Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SPTAN1Q13813 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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