Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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TOP3AQ13472 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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