Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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