Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms