Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN4PQ13434 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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