Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDE3BQ13370 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms