Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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