Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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