Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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