Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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