Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms