Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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