Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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RABGEF1Q9UJ41 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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