Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms