Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIST2H2ACQ16777 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms