Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms