Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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SGCBQ16585 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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