Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms