Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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