Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCF4Q15080 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCF4Q15080 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCF4Q15080 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCF4Q15080 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NCF4Q15080 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms