Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SSPNQ14714 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms