Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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