Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms