Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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