Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
C1orf61Q13536 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms