Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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