Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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NFIAQ12857 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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NFIAQ12857 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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NFIAQ12857 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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NFIAQ12857 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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NFIAQ12857 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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NFIAQ12857 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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