Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN12Q05209 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms