Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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