Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPREP23469 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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