Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
R4GMQ9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
R4GMQ9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
R4GMQ9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
R4GMQ9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms