Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms