Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFG3L2Q9Y4W6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms