Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
WASHC2CQ9Y4E1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WASHC2CQ9Y4E1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms