Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms