Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF5Q9Y2D1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF5Q9Y2D1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms