Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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