Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms