Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms