Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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TMOD3Q9NYL9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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TMOD3Q9NYL9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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TMOD3Q9NYL9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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TMOD3Q9NYL9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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