Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms