Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM106BQ9NUM4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms