Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC17Q9NP64 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms