Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms