Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF408Q9H9D4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms