Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms