Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms