Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms