Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHCHD7Q9BUK0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHCHD7Q9BUK0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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