Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms